肽长度计算器

从序列算出来的东西，几乎没有一样是离开长度就算不出来的，这就是为什么一个只返回一个整数、什么都不多给的页面依然值得占一个位置。百分比除以它，平均值除以它。 脂肪族指数计算器 把它的四个残基计数换算成摩尔百分比，靠的就是除以它，而在那里把百分数和分数混为一谈是典型的错误。链较短时净电荷的计算也会换一副样子，因为那时两个末端基团会占据分子中全部可电离位置的很大一部分。这些数字没有一个能在不看它底下那个计数的情况下被核对。

解析器一旦接受了这个字符串，这个计数就没有单位也没有歧义，而这正是它应该被算出来而不是被猜出来的理由。推断出来的长度几乎总是一个假设：拿质量除以平均残基质量，从一份把末端那个水也算成残基的产品说明书上抄下来的数字，或者把产品名称取整到最接近的五个。这是三种不同的错，而只要直接数一遍就摆在你面前的字符，三种错都会立刻暴露。

长度对替换是盲的，而这正是值得记住的一条局限。把一个残基换成另一个，各个位置的计数全都一样，于是本页会为两个可能毫无共同化学性质的分子返回同一个整数。两条等长的序列在净电荷、平均疏水性、芳香族含量和紫外吸光度上都可能完全不同。这个数字确立的是一个尺寸类别，它从来不确立同一性，而无论你多小心地读它，这一点都不会改变。

同一个方向上还有第二处盲区，这也是 质量推测序列估算器 上的反向计算报出一个估算值而不是一个答案的原因。亮氨酸和异亮氨酸在平均标尺和单同位素标尺上都是等质量的，所以质量无法把含其中一条的链和含另一条的链区分开，残基计数同样做不到。当问题的关键恰好是要把这两种区分开时，任何依据残基列表工作的计算器都给不出定论。把这一点说明白，比给出一个自信的数字更有用。

一条由 n 个残基组成的链有 n 减 1 个肽键，理由是结构上的，而不是约定上的。链是线性的。每个内部残基与两个邻居相连，每个末端残基只与一个相连，所以连接处的数目总是比位置数少一个。同一个差一也在化学里再次出现：连在一起的 n 个残基恰好失去了 n 减 1 个水分子，这就是为什么分子量是各残基质量之和再加一个水，而不是游离氨基酸质量之和。

这些数字每一个在某个地方都会被用到，把它们混起来是可靠的出错方式。 由序列求分子量 把这里的算术讲清楚， 平均分子量计算器 把它执行出来。值得养成的习惯是把长度写下来一次，然后由它推出键数和水数，而不是再凭眼睛数一遍，因为一条从屏幕上读两遍的链，就是一条可能被读出两个不同结果的链。

计数只是一个尺寸，除此以外它对什么都不发言。它不告诉你一条链是否会折叠，是否会溶解，两端是否被封住，是否带电，也不告诉你摆在你面前的样品是否就是那个分子。长度相同的两条多肽可以表现得毫无相似之处，而每一个真正与行为有关的描述量都需要组成一起。 GRAVY 疏水性计算器 之所以要除以长度而不是忽略它，原因就在这里：把一个和变成按残基的平均值，靠的正是长度。

它的实际用途是一道关口，而不是一个结果。如果长度不是你其余工作所假设的那个数，那么下游每一个百分比和每一个平均值都在不知不觉中错了，而后面步骤里再多的仔细也补不回来。如果长度是对的，而序列的其他部分却没有一样符合预期，那完全是另一个问题，该从哪里下手是残基清单，而不是这个计数。