多肽分子量 = 所有残基质量之和 + 18.01528 Da(一分子水),无需物理称重即可直接根据线性氨基酸序列精确计算。本文剖析残基加和算法原理及每个肽键扣除一个水分子的化学逻辑。
肽键缩合反应与失水机制
当两个游离氨基酸脱水缩合形成肽键时,会释放一个水分子(H2O)。对于含有 n 个残基的单链多肽,共有 n - 1 个肽键,因而总共脱去 n - 1 个水分子。
标准参考表已将残基定义为游离氨基酸减去一个水分子后的质量。因此,只需将所有残基的残基质量相加,最后补上整条链两端游离基团对应的一个水分子即可。
如何根据序列计算多肽分子量
平均分子量 = 残基平均质量总和 + 18.01528 Da
单同位素质量 = 残基单同位素质量总和 + 18.010565 Da
质量向物质的量(摩尔)换算
物质的量 (mol) = 质量 / 分子量
使用质量转摩尔计算器可以在配制储备液时快速换算微克或毫克量级。
末端修饰计算
末端修饰计算器支持 N 端乙酰化及 C 端酰胺化等常见封端修饰的质量校正。
简而言之:多肽分子量 = 残基平均质量总和 + 18.01528 Da(或单同位素质量总和 + 18.010565 Da)。