Le poids moléculaire d un peptide peut être calculé exactement à partir de sa séquence d acides aminés sans pesée physique. Cet article expose les calculs arithmétiques: comment sommer les masses des résidus et pourquoi une molécule d eau est soustraite par liaison peptidique.
La liaison peptidique et la perte d une molécule d eau
Lorsque deux acides aminés s assemblent pour former une liaison amide (peptidique), ils libèrent une molécule d eau (H2O). Pour une chaîne linéaire de n résidus, il y a n - 1 liaisons peptidiques et donc n - 1 molécules d eau éliminées.
Les tables publiées fournissent directement la masse des résidus (acide aminé moins une molécule d eau). Dès lors, la sommation de ces résidus complétée par l ajout d une molécule d eau finale restitue la masse de la chaîne entière.
Comment calculer le poids moléculaire d un peptide ?
poids moléculaire moyen = somme(masses moyennes des résidus) + 18,01528 Da
masse monoisotopique = somme(masses monoisotopiques des résidus) + 18,010565 DaLe calculateur de poids moléculaire moyen et le calculateur de masse monoisotopique appliquent ces sommes standardisées.
Conversion en moles et concentration molaire
Pour convertir une masse pesée en quantité de matière:
moles = masse / poids moléculaireLe calculateur de masse en moles effectue cette conversion instantanément pour faciliter les préparations de stock.
Vérification et modifications chimiques
Le calculateur de vérification de masse molaire confronte une valeur de certificat avec la séquence. Pour les peptides modifiés, le calculateur de modifications terminales ajoute la masse des groupements bloquants (acétylation N-terminale, amidation C-terminale).
En résumé, le poids moléculaire d un peptide s obtient en additionnant les masses de ses résidus puis en ajoutant 18,01528 Da pour la molécule d eau finale.