平均分子量按天然同位素丰度加权计算，单同位素质量只取每种元素丰度最高的单一同位素，因此多肽在文献中常标有两个不同的分子量数值。本文阐明二者的物理化学差异及其在实验检测中的选用原则。
同一原子的两种称量方式
自然界中的大多数化学元素以同位素混合物的形式稳定存在。
**平均分子量（Average Molecular Weight）**按照自然界中的同位素丰度加权平均计算。这是元素周期表中所列的摩尔质量，也是在天平上称量干燥粉末时所对应的宏观物理量。
**单同位素质量（Monoisotopic Mass）**仅采用每种元素丰度最高的主同位素（^12C、^1H、^14N、^16O、^32S）的精确原子核质量，代表该分子理论上最轻的同位素形式。
两者的计算公式是什么
两类指标均通过累加氨基酸残基质量并加上两端游离基团对应的一个水分子得出：
平均分子量 = 残基平均质量之和 + 18.01528 Da
单同位素质量 = 残基单同位素质量之和 + 18.010565 Da差异随序列长度逐步累积
对于单个氨基酸残基，两者差异通常小于 0.1 Da。而在几十个残基组成的长链多肽中，每增加一个残基都会累积微小的同位素质量差，使得总差异可达数个 Dalton。
正确的使用场景
平均分子量适用于试剂称量配制、摩尔浓度计算以及质量转摩尔计算器。
单同位素质量则是高分辨率质谱检测（MALDI-TOF、LC-MS/MS）的基础基准。
辅助校验工具
分子式计算器列出各元素原子数量，而摩尔质量交叉核验计算器可核实出厂质检报告是否与序列匹配。
简而言之：平均分子量 = 残基平均质量之和 + 18.01528 Da，单同位素质量 = 残基单同位素质量之和 + 18.010565 Da。