हाइड्रोफोबिक अवशेष अंश कैलकुलेटर

यह प्रतिशत अवशेषों का मोल अंश है, बिल्कुल वैसा ही जैसा साइट का हर दूसरा संघटन आँकड़ा। यह द्रव्यमान अंश नहीं है, और दोनों की रूपांतरण लंबे रास्ते से होती है: दोनों कुलों की तुलना से पहले हर अवशेष गिनती को उस अवशेष की तालिका में दर्ज द्रव्यमान से भारित करना पड़ता है। औसत आणविक भार कैलकुलेटर यही भारन करता है, और सवाल गिनती का नहीं, द्रव्यमान का हो तो यही सही जगह है।

यह सतह का अंश भी नहीं है, और यही भ्रम अधिक लुभावना है, क्योंकि पानी से अंतरक्रिया को वास्तव में सतह का खुला होना तय करता है। गिनती किसी वलित संरचना के बाहर रखे अवशेष को बीच में दफने अवशेष से अलग नहीं कर सकती, और बिल्कुल वलित नहीं शृंखला में तो दोनों में कोई भेद ही नहीं होता। यह संख्या उसी शृंखला का वर्णन करती है जिसका वर्णन अनुक्रम करता है, अर्थात अवशेषों की एक क्रमबद्ध सूची का। तीन आयामों में उन अवशेषों की स्थिति के बारे में सब कुछ यहाँ ग़ैरहैर है।

यहाँ हाइड्रोफोबिक वर्ग में तीनों एरोमैटिक अवशेष शामिल हैं, जिन्हें ऐरोमैटिकिटी कैलकुलेटर भी गिनता है। यह दोहरी गिनती जानबूझकर है, त्रुटि नहीं, और यही कारण है कि हाइड्रोफोबिक और एरोमैटिक प्रतिशत एक-दूसरे से स्वतंत्र नहीं हैं। चार वर्ग प्रतिशतों को जोड़कर कुल को सौ से मिलाने की कोई भी कोशिश किसी भी ऐसे अनुक्रम में विफल होगी जिसमें फेनिलएलनिन, ट्रिप्टोफैन या टायरोसिन हो।

यह अंकगणित सबसे साफ़ देखने का तरीका ऐसा अनुक्रम है जिसमें केवल एरोमैटिक अवशेष हों, जहाँ हाइड्रोफोबिक और एरोमैटिक दोनों सौ हैं और आवेशित तथा ध्रुवीय दोनों शून्य हैं। ऐलिफैटिक अवशेषों की लंबी शृंखला में एक टायरोसिन जोड़िए और हाइड्रोफोबिक, एरोमैटिक तथा ध्रुवीय तीनों एक साथ बदल जाते हैं, इतने अलग-अलग अंतरों से जिनका एक-दूसरे से कोई संबंध नहीं। वर्ग सूचियाँ रचना से ही ओवरलैप करती हैं, क्योंकि एक बाजू शृंखला सचमुच कई उपयोगी वर्णनों में आती है। ध्रुवीय अवशेष अंश कैलकुलेटर टायरोसिन को ठीक इसीलिए ध्रुवीय गिनता है, और आवेशित अवशेष अंश कैलकुलेटर वही है जिसके वर्ग इनसे ओवरलैप नहीं करते।

एक अकेला अवशेष बदलने से यह प्रतिशत n के ऊपर एक सौ से हिलता है, यानी चार अवशेषों की शृंखला पर 25 अंक, दस अवशेषों की शृंखला पर 10 अंक और चालीस अवशेषों की शृंखला पर 2.5 अंक। छोटे पेप्टाइड पर इसलिए गिनती का विभेदन मोटा होता है, और बाकी सब एक जैसे दो पेप्टाइडों के बीच एक अवशेष का अंतर बताए गए आँकड़े को पूरे का चौथाई हिला सकता है। बहुत अलग लंबाई वाले पेप्टाइडों के बीच तुलनाएँ तदनुसार कमज़ोर होती हैं, और छोटी शृंखला और लंबी शृंखला के बीच कुछ प्रतिशत का अंतर कुछ और नहीं हो सकता, सिवाय लंबाई के अंतर के।

यही वह अंकगणित है जो छोटी शृंखला पर औसत को अविश्वसनीय बनाता है, और इसीलिए GRAVY वाले पृष्ठ का स्कोर माप के बजाय छाँटने का उपकरण पढ़ा जाना चाहिए। दोनों राशियाँ अवशेष वर्गों की एक ही अंतर्निहित तालिका पर टिकी हैं। GRAVY स्कोर और काइट-डूलिटल हाइड्रोफोबिसिटी यहाँ उपयोगी है, क्योंकि यह वे प्रति अवशेष मान रखती है जिन पर गिनती और औसत दोनों निर्भर हैं।

इस वर्ग का हर अवशेष इस अर्थ में अध्रुवीय है कि उसकी बाजू शृंखला में न कोई औपचारिक आवेश होता है और न कोई हाइड्रोजन बंध समूह, और यह खींची गई रेखा उचित है। यह केवल एक रेखा है, और कोई दूसरी रेखा भी उचित होती। ग्लिसिन और प्रोलिन यहाँ गिने जाते हैं, भले ही उनकी बाजू शृंखलाओं का पानी में व्यवहार एक नाम से अधिक जटिल हो, और तालिका बनाने के लिए सुविधाजनक वर्गीकरण किसी खास सवाल के लिए स्वतः सबसे सूचक नहीं होता।

गिनती जिसके लिए अच्छी है वह किसी अनुक्रम के रासायनिक स्वरूप के बारे में एक तेज़, पुनरावर्ती कथन है और एक ही आधार पर वर्णित अनुक्रमों की तुलना। जिसके लिए यह नहीं है, वह भविष्यवाणी। उच्च हाइड्रोफोबिक अंश कम जलीय घुलनशीलता और समूहन की झुंक से जुड़ा है, और यह संबंध इतना वास्तविक है कि जानने योग्य है, पर यह सीमा नहीं, संबंध है, और जिस सांद्रता पर कुछ होता है वह इस संख्या में नहीं है। शुद्ध आवेश कैलकुलेटर आमतौर पर इससे अधिक व्याख्या बदल देता है, क्योंकि मध्यम pH पर व्यवहार को हाइड्रोफोबिसिटी नहीं, आवेश तय करता है।