आवेशित अवशेष अंश कैलकुलेटर

इस पृष्ठ का सबसे महत्वपूर्ण भेद उन अवशेषों की गिनती के बीच है जो आवेश धारण कर सकते हैं, और आवेश के बीच। पहली एक पूर्ण संख्या है जो लंबाई से भाग दी गई है। दूसरा चिह्नित, आंशिक और pH पर निर्भर एक फलन है। इस गिनती के हिसाब से कोई शृंखला पचास प्रतिशत आवेशित होते हुए भी सकुल धनात्मक, सकुल ऋणात्मक, या लगभग उदासीन हो सकती है, यह पूरी तरह इस पर निर्भर है कि कौन से प्रकार मौजूद हैं। शुद्ध आवेश कैलकुलेटर चिह्नित संख्या लौटाता है, और दोनों के अलग-अलग सवालों के उत्तर देना किसी एक की कमी नहीं है।

यह गिनती शृंखला का एक अनुपात है और इसमें कोई इकाई नहीं है। यह बताती है कि अनुक्रम का कितना भाग विद्युत स्थिरवैद्युतिक अंतरक्रिया के लिए तैयार है, जो जानने योग्य एक वास्तविक और उपयोगी बात है, और यह उस अंतरक्रिया की दिशा, किसी विशेष pH पर उसका परिमाण, या समूहों की विन्यास के बारे में कुछ भी नहीं कहती। स्थानों पर लगी गिनती में से कोई चिह्न वापस नहीं पा सकती, क्योंकि चिह्न यह तय करता है कि कौन से प्रकार की बाजू शृंखलाएँ मौजूद हैं, कितनी नहीं।

हिस्टिडिन को यहाँ पूरी तरह आवेशित एक अवशेष गिना जाता है, और यही इस आँकड़े और मॉडल किए गए आवेश के बीच असहमति का सबसे बड़ा एकल स्रोत है। इस साइट पर इस्तेमाल की गई तालिका में इसकी बाजू शृंखला का pKa 6.0 पर बैठता है, और pH 7 पर वास्तव में प्रोटोनयुक्त अंश एक का दस की एक घात के योग में एक से भाग है, जो लगभग नौ प्रतिशत होता है। इसलिए हिस्टिडिन इस गिनती में एक और उदासीन pH पर आवेश में लगभग 0.09 जोड़ता है, और इन दोनों संख्याओं के बीच का अंतर छोटा नहीं है।

यह असममितता साफ़ कहने लायक है क्योंकि वर्गीकरण में यह एक ही दिशा में चलती है। यहाँ आवेशित गिने जाने वाले किसी अन्य अवशेष की गिनती हिस्टिडिन जितनी अधिक नहीं होती, क्योंकि अम्लीय और प्रबल क्षारीय समूह वास्तव में कार्य परास के अधिकांश भाग में लगभग पूरी तरह एक ही अवस्था में रहते हैं। इसी कारण छोटी अम्लीय शृंखला ऐसी गिनती और आवेश देती है जो ठीक-ठीक मेल खाते हैं, जबकि हिस्टिडिन पर टिकी शृंखला नहीं देती। पेप्टाइड नेट चार्ज और pH: हेंडरसन-हैसेलबैक प्रति-समूह अंकगणित रखती है, और आवेश बनाम pH वक्र कैलकुलेटर दिखाता है कि अपने pKa के पास बैठा समूह कितना हिल सकता है।

इस प्रतिशत में कोई भी टर्मिनल समूह नहीं आता, और छोटे पेप्टाइड के लिए यह छूट बड़ी है। दो अम्लीय बाजू शृंखलाओं वाली चार अवशेषों की शृंखला इस गिनती से पचास प्रतिशत आवेशित होती है, जबकि अणु में वास्तव में चार आयनीकरण योग्य समूह होते हैं: दो बाजू शृंखलाएँ, एक क्षारीय N-टर्मिनस और एक अम्लीय C-टर्मिनस। आयनीकरण योग्य स्थानों का वास्तविक अंश इसलिए पचास नहीं, सौ प्रतिशत है, और पूरा अंतर इन दोनों सिरों में बैठा है।

टर्मिनल सबसे आसानी से हटाने वाले समूह भी हैं और हटाने वाले सबसे बड़े भी। किसी सिरे का एमिडेशन या एसिटिलेशन पूरा एक आवेश हटा देता है, जो छोटी शृंखला पर आराम से घुलनशील पेप्टाइड और ऐसे पेप्टाइड के बीच का अंतर हो सकता है जिसे लगता था कि उसके पास केवल आधी विद्युत स्थिरवैद्युतिक सहायता है। टर्मिनल संशोधन कैलकुलेटर द्रव्यमान परिवर्तन देता है, और शुद्ध आवेश वाले पृष्ठ की अंकगणित वही जगह है जहाँ आवेश पर इसका परिणाम वास्तव में निकाला जाता है, क्योंकि दोनों टर्मिनल वहाँ स्वतः गिने जाते हैं।

चार में से एक संख्या के रूप में देखने पर, आवेशित अंश सबसे उपयोगी इस बात में है कि वह किसी अनुक्रम को गिनती-आधारित दृष्टि के दोनों ध्रुवों के बीच कहाँ रखता है। अधिक ध्रुवीय अंश के साथ अधिक आवेशित अंश यह कहता है कि पेप्टाइड को पानी में मुख्यतः आवेश और बाजू शृंखला हाइड्रोजन बंधन ही थामे हुए हैं। कम ध्रुवीय अंश के साथ अधिक आवेशित अंश यह कहता है कि पानी में उसका व्यवहार बहुत कम सहकारी हाइड्रोजन बंधन के साथ विद्युत स्थिरवैद्युतिकी से प्रधान है, और उदासीन सतह से बंधन करने वाली किसी भी चीज़ के लिए इन दोनों के अलग-अलग निहितार्थ हैं।

वर्ग साफ़ नहीं, परंपरा से ओवरलैप करते हैं, और इसीलिए चारों प्रतिशतों का मिलकर सौ होना अपेक्षित नहीं है। टायरोसिन इनमें से तीन में आता है, हिस्टिडिन आवेशित सूची में ऐसे रूप में आता है जो उसे बढ़ा देता है, और ध्रुवीय अवशेष अंश कैलकुलेटर वह साथी है जो हाइड्रोजन बंधन वाला हिस्सा भरता है। जहाँ गिनती के बजाय pH पर निर्भरता का सारांश चाहिए, वहाँ समविद्युत बिंदु (pI) कैलकुलेटर वह pH लौटाता है जिसपर वह आवेश, जिसे यह गिनती नहीं दे सकती, शून्य से होकर गुज़रता है।