अमीनो एसिड संरचना कैलकुलेटर

संघटन पेप्टाइड के व्यवहार का कोई गुण नहीं है। यह एक सूची है, और इसका मूल्य इससे आता है कि यही वह सामग्री है जिससे किसी पेप्टाइड पृष्ठ का हर दूसरा वर्णक बनता है। औसत हाइड्रोपैथी एक भारित योग को अवशेष संख्या से भाग देकर निकाला जाता है। विलोपन गुणांक ट्रिप्टोफैन, टायरोसिन और सिस्टीन युग्मों पर भारित योग है। आणविक भार अवशेष द्रव्यमानों का योग है। इनमें से हर एक में इस पृष्ठ वाली गिनती या तो भाजक है या योग का एक पद, इसलिए संघटन की त्रुटि अपने पास तक सीमित नहीं रहती, वह उसके बाद गणे गए हर अंक में फैल जाती है।

इसलिए बाकी सबसे पहले गिनती करना एक अनुशासन है, औपचारिकता नहीं, क्योंकि यही वह संख्या है जिसे जाँचना सबसे सस्ता पड़ता है और जिसका दूसरे पृष्ठों में सबसे अधिक उपयोग होता है। अनुलेखन की चूक लगभग हमेशा यहीं दिख जाती है। एक अवशेष के स्थान पर दूसरा आ जाने से लंबाई वैसी ही रहती है, जबकि एक गिनती बढ़ जाती है और दूसरी घट जाती है, और यह लंबाई की जाँच नहीं देख सकती जबकि संघटन तालिका इसे तुरंत साफ़ कर देती है। किसी अवशेष के हटने से लंबाई बदल जाती है, इसलिए लंबाई उसे पहले ही पकड़ लेती है, पर संघटन फिर बताती है कि कौन सी गिनती कितनी कम है, और इतना अक्सर जगह तक पहुँचाने के लिए काफ़ी होता है।

इस पृष्ठ के प्रतिशत मोल अंश हैं, जिन्हें प्रतिशत के रूप में लिखा गया है। ये द्रव्यमान अंश नहीं हैं, और दोनों अवशेष दर अवशेष बड़े अंतर तक अलग हो सकते हैं। रूपांतरण का अर्थ पूरी तालिका को एक गुणक से नापना नहीं है। हर प्रतिशत को उस अवशेष की तालिका में दर्ज द्रव्यमान से गुणा करना पड़ता है, परिणाम जोड़ने पड़ते हैं, और कुल को आगे बाँटना पड़ता है। वही भारित चरण औसत आणविक भार कैलकुलेटर करता है, इसलिए दोनों पृष्ठ मिलकर मोल संघटन और उसके हर हिस्से द्वारा धारा द्रव्यमान देते हैं।

GWWY की शृंखला यह अंतर साफ़ दिखाती है। चार में से तीन स्थान एरोमैटिक अवशेष हैं, इसलिए गिनती के हिसाब से प्रत्येक श्रृंखला का 75 प्रतिशत है, और प्रत्येक का अवशेष द्रव्यमान किसी पेप्टाइड के औसत से कहीं अधिक है। उन तीन स्थानों का हिस्सा इसलिए द्रव्यमान में 75 प्रतिशत से कहीं अधिक हो जाता है। यहाँ कुछ भी असंगत नहीं है: दोनों संख्याएँ दो अलग सवालों के उत्तर हैं, और जिस पाठक को द्रव्यमान का बँटवारा चाहिए उसे मान लेने के बजाय बदलना पड़ेगा। गिनती से शुरू होने वाला कोई भी अनुमान इस बात पर निर्भर करता है कि वह इनमें से किससे शुरू हुआ था, और उसी हिसाब से अलग बदलता है।

बीस अवशेषों को प्रत्येक को ठीक एक ही वर्ग में रखा गया है, और यही वह बात है जिससे वर्ग प्रतिशत निकालना आसान हो जाता है और उन्हें जोड़ना अटपटा। ऐरोमैटिकिटी कैलकुलेटर और हाइड्रोफोबिक, ध्रुवीय तथा आवेशित अंश वाले पृष्ठ सब एक ही वर्गीकरण पढ़ते हैं और केवल इस बात में भिन्न हैं कि वे किन वर्गों को जोड़ते हैं। कीमत यह है कि एक ही अवशेष इनमें से एक से अधिक सवाल का एक साथ उत्तर दे सकता है। टायरोसिन इसलिए एरोमैटिक है कि उसका वलय तंत्र पराबैंगनी प्रकाश अवशोषित करता है, इसलिए ध्रुवीय है कि उसका फीनॉलिक हाइड्रॉक्सिल पानी से हाइड्रोजन बंध बनाता है, और अपनी अधिकांश सतह पर अध्रुवीय है। एक वर्गीकरण, तीन उचित सवाल, तीन परस्पर ऊपर लगे उत्तर।

किसी वर्ग को व्यवहार के बजाय जुड़ाव के कथन के रूप में देखना उचित है, क्योंकि वह वास्तव में यही है। सिस्टीन इसलिए ध्रुवीय सूचीबद्ध है क्योंकि मुक्त थायोल हाइड्रोजन बंध बनाता है, और जिस सिस्टीन ने डाइसल्फाइड बना लिया है उसके पास ऐसा कोई समूह नहीं बचता। हिस्टिडिन इसलिए क्षारीय सूचीबद्ध है क्योंकि वह प्रोटोन ग्रहण कर सकता है, और अपने pKa से कहीं ऊँचे pH पर वह मुख्यतः प्रोटोनरहित और मुख्यतः उदासीन होता है। दोनों में से कोई भी नाम ग़लत नहीं है, और जिस वातावरण के लिए यह वर्गीकरण बनाया गया था उसके अलाव किसी वातावरण में दोनों ही कम काम के हैं, और यही अच्छा कारण है कि सवाल आवेश का हो, सदस्यता का नहीं, तो शुद्ध आवेश कैलकुलेटर तक पहुँचना चाहिए।

एक लुभावना कदम यह है कि इस पृष्ठ को उलट लिया जाए: कोई आणविक भार लिया जाए और पूछा जाए कि किस संघटन ने उसे बनाया। यह दो स्वतंत्र कारणों से विफल होता है, और अकेला कोई भी कारण काफ़ी है। ल्यूसिन और आइसोल्यूसिन के अवशेष द्रव्यमान तालिका में औसत और मोनोआइसोटोपिक दोनों पैमानों पर एक जैसे दर्ज हैं, इसलिए बिल्कुल सही द्रव्यमान भी दोनों के बीच एक अटूट चुनाव छोड़ देता है। इसके अलावा किसी भी दिए गए अवशेष समूह को किसी भी क्रम में लिखा जा सकता है, और क्रम द्रव्यमान में कोई चिह्न नहीं छोड़ता। द्रव्यमान न यह तय करता है कि कौन से अवशेष मौजूद हैं, न यह कि वे कहाँ बैठे हैं।

द्रव्यमान से अनुक्रम अनुमानक यह अस्पष्टता छिपाने के बजाय उजागर करता है, और वह आपके लिए कोई संघटन नाम नहीं करेगा। संघटन केवल आगे की दिशा में भरोसेमंद है: अनुक्रम आपके पास है, और सवाल यह है कि वह किससे बना है। उसके आगे अनुक्रम से पेप्टाइड का आणविक भार कैसे निकालें यह बताता है कि गिनतियाँ और अवशेष द्रव्यमान आपस में कैसे मिलते हैं, आणविक सूत्र कैलकुलेटर हर पेप्टाइड बंध के लिए एक जल घटाकर उसी संघटन को तत्व गिनती तक ले जाता है, और विलोपन गुणांक कैलकुलेटर तीन अवशेष गिनतियों के साथ एक बंध गिनती भी इस्तेमाल करता है जो आपको खुद देनी पड़ती है।