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Peptide Calculator

Calculadora de absorbancia de Beer-Lambert

Aplica la ley de Beer-Lambert, A = épsilon x c x l, para calcular la absorbancia a partir del coeficiente de extinción, la concentración y el paso óptico. Referencia educativa, no es consejo médico.

Analisis de secuencia

Campos de la calculadora

Esta es una herramienta de referencia matematica y de laboratorio. No diagnostica, trata ni recomienda una dosis, y no constituye consejo medico.

La calculadora de absorbancia de Beer-Lambert es el sentido directo. Dados un coeficiente de extinción, una concentración molar y una longitud de paso, devuelve la absorbancia que deberías esperar leer en un espectrofotómetro.

Es la aritmética que hay detrás de cualquier concentración medida por UV, y el sentido contrario de la calculadora de concentración de este sitio.

La ley es una de las relaciones más casi universales de la química práctica, y se cumple a lo largo de varios órdenes de magnitud de concentración antes de que la desviación se vuelva significativa.

Lo que la ley supone sobre el haz y sobre la muestra

La imagen que describe la ley es un haz colimado que entra en una solución homogénea y sale más débil. La luz la quitan moléculas absorbentes, y el número que un haz deja pasar a su paso es proporcional a la distancia que recorre, que es la longitud de paso. Multiplica eso por cuántas moléculas hay presentes por unidad de volumen y tienes algo proporcional a la absorbancia, y la constante de proporcionalidad es el coeficiente de extinción. Ese único número hace tres trabajos a la vez, ya que recoge en sí la longitud de onda, la identidad y el número de los grupos absorbentes, y el disolvente en el que están. La calculadora de coeficiente de extinción cubre la parte del péptido en esa constante.

Una consecuencia que merece retenerse es que la absorbancia no lleva ninguna unidad. La transmitancia es un cociente entre dos intensidades y por tanto no tiene dimensiones, y la absorbancia es su logaritmo negativo, así que hereda esa propiedad. La ley solo es dimensionalmente coherente por eso: los centímetros molares inversos del coeficiente, los moles por litro de la concentración y los centímetros de la longitud de paso se cancelan exactamente y dejan un número puro que un espectrofotómetro puede mostrar sin ninguna unidad detrás. Por eso un visor que marca 0.4 y otro que marca 40 no son por casualidad dos concentraciones distintas: son dos lecturas de la misma relación, una en absorbancia y otra en transmitancia, y el visor no da ninguna pista de en cuál de las dos está.

La ley es una ecuación con cuatro cantidades, así que cualesquiera tres determinan la cuarta. Esta página despeja la absorbancia. La calculadora de concentración de Beer-Lambert despeja la concentración y la calculadora de longitud de paso de Beer-Lambert despeja la longitud de paso. Las matemáticas son idénticas en las tres disposiciones y las suposiciones que hay debajo también, así que un desacuerdo entre las tres solo puede haber venido de una entrada y nunca de la manera de reordenar la ecuación. Eso merece saberse cuando un resultado parece estar mal, porque estrecha la búsqueda a los números y no a la fórmula, y también es la razón de que un viaje de ida y vuelta por dos cualesquiera de las tres páginas sea una comprobación legítima de toda una cadena de aritmética anterior.

Por qué la absorbancia es logarítmica y qué cambia eso

La definición logarítmica es donde vive casi toda la confusión, y merece la pena hacer una conversión bien en lugar de confiar en la intuición. Con una absorbancia de 0.055, la transmitancia es diez elevado a menos 0.055, que es aproximadamente 0.88, así que alrededor del 88 por ciento de la luz incidente todavía llega al lado opuesto de la cubeta. Esa es una afirmación realmente útil, porque dice que la muestra absorbe muy poco del haz, que es exactamente la condición en la que una lectura es frágil en lugar de sólida.

También significa que un movimiento pequeño en la absorbancia es un movimiento grande en la luz. Una absorbancia de 1 deja una décima parte de la luz, 2 deja una centésima y 3 deja una milésima. Por eso dividir la concentración por dos no divide la absorbancia por dos, sino que la mueve en 0.3, porque la concentración y la absorbancia no están en la misma escala y nunca lo han estado. Los instrumentos suelen ser lineales en la luz transmitida dentro de una ventana limitada y no lineales en absorbancia a lo largo de todo el rango, y esa es la razón por la que una lectura cerca del techo de la escala utilizable es la que merece sospecha.

Para los péptidos hay una versión práctica de esto que va de dónde apuntar y no de dónde evitar. Una absorbancia prevista de alrededor de 0.4 es una lectura cómoda con margen por los dos lados. Un valor previsto de 0.04 está cerca de lo que un instrumento de mesa puede resolver, y un valor previsto de 0.004 es indistinguible de un blanco. Cuando conoces de antemano el coeficiente y la concentración, esta página te dice en cuál de esos tres casos estás antes de coger una cubeta, y la guía sobre redondeo y precisión en volúmenes pequeños cubre lo que le pasa a un número pequeño una vez que está escrito.

Dónde deja de cumplirse la linealidad en una cubeta real

La ley sobrevive en un rango amplio precisamente porque las moléculas individuales absorben de forma independiente entre sí. Se rompe allí donde esa independencia falla, y las causas comunes son físicas más que químicas. La dispersión y la turbidez desvían la luz fuera del haz sin absorberla, y sin embargo la mayoría de los instrumentos no tienen forma de distinguir absorción de desvío e informan de la cifra mayor, así que una muestra turbia o con partículas se lee como más concentrada de lo que es. El trabajo con Beer-Lambert cubre las comprobaciones que atrapan esto antes de fiarse de un resultado. Una solución que a simple vista parece totalmente clara todavía puede llevar partículas lo bastante pequeñas como para dispersar, así que la claridad no es la prueba y una comprobación visual tampoco.

La luz espuria empuja en el sentido contrario y es la razón por la que una muestra perfectamente buena puede parecer no tener concentración medible. Cualquier luz que llega al detector sin pasar por la muestra se suma a la lectura de una manera que el cociente no puede ver. Así que a absorbancias bajas el instrumento cree que pasó más luz de la que pasó de verdad, subestima la absorbancia e informa de una concentración demasiado baja. Diluir más para compensarlo empeora la discrepancia en lugar de mejorarla. El error se reduce a medida que crece la señal, lo cual es otra manera de decir que el problema no es la ley sino el cociente entre una cantidad muy pequeña y un desplazamiento del instrumento.

Un cambio en la propia muestra es la tercera causa y la más difícil de detectar. Un péptido que se agrega en partículas deja de ser un conjunto de moléculas independientes, y uno que se ha adsorbido sobre el vidrio deja de estar todo en solución. Las dos cosas alteran la relación entre concentración y absorbancia, y ninguna se anuncia en la salida, que sigue pareciendo una banda de absorción limpia con una cifra verosímil pegada. La forma fiable de ponerlo al descubierto es una serie de diluciones conocidas: una relación recta a lo largo de la serie significa que la ley se está cumpliendo en ese rango, y una curva significa que no.

Usar una absorbancia prevista para planificar la medición

El uso más económico de esta página es como una predicción que se contrasta con un instrumento y no como un cálculo que lo sustituya. Predice la absorbancia y luego toma la lectura. Si coinciden, el coeficiente, la concentración y la longitud de paso son mutuamente coherentes, lo que convierte esto en la prueba más barata disponible de toda una cadena de aritmética. Si no coinciden, el tamaño y la dirección de la discrepancia te dicen qué entrada sospechar antes de cambiar nada, y a menudo la respuesta es sencillamente que la muestra era más diluida de lo que asumía el cálculo. Para el lado de la concentración de esa comparación, la calculadora de molaridad es de donde sale la cifra molar.

Ejecutar las tres calculadoras de este sitio como un viaje de ida y vuelta aplica la misma idea a los números y no al instrumento. Toma una absorbancia, pásala por la calculadora de concentración y debería volver como el valor del que partiste. La calculadora de longitud de paso hace lo mismo con la longitud de paso. Entre las dos aíslan cuál de las cuatro cantidades no es lo que crees, que es un enfoque mucho más eficiente que ajustar entradas hasta que la respuesta parezca razonable. También atrapa el error concreto que más difícil es detectar a ojo, que es una concentración o un coeficiente introducidos en la unidad equivocada y luego analizados perfectamente por una página que no tenía motivo alguno de objetarlo.

Como funciona esta calculadora

La absorbancia se define como el logaritmo negativo de la transmitancia, así que es una magnitud logarítmica. La ley de Beer-Lambert dice que la absorbancia es proporcional a la concentración y a la longitud de paso, con el coeficiente de extinción como constante de proporcionalidad.

Como la absorbancia es logarítmica, una muestra al doble de concentración se lee con el doble de absorbancia y no con el doble de luz. La relación es lineal en absorbancia y logarítmica en intensidad luminosa, y confundir las dos cosas es una fuente habitual de malentendidos.

Las formulas

  • A = e x c x l

    A
    absorbancia, sin unidades, a menudo llamada densidad óptica
    e
    coeficiente de extinción en M^-1 cm^-1
    c
    concentración molar en mol/L
    l
    longitud de paso en centímetros

    La concentración tiene que ser molar. Una concentración en masa en mg/mL da una respuesta equivocada por la masa molar.

Ejemplo resuelto

Absorbancia de un péptido con triptófano a 10 uM

Ejemplo ilustrativo. Los numeros se eligen para que la aritmetica sea facil de comprobar. No son una dosis, un protocolo ni una recomendacion.

Datos

Coeficiente de extinción
5500 M^-1 cm^-1
Concentración
0.00001 M (10 uM)
Longitud de paso
1 cm
  1. Multiplicar los tres
    Sustitucion
    5500 x 0.00001 x 1
    Resultado
    0.055

Lo que demuestra

Una absorbancia de 0.055 es un número pequeño, y las absorbancias pequeñas son donde domina el error de medición. Un espectrofotómetro exacto hasta más o menos 0.005 de absorbancia ya está entregando un error de diez por ciento a esta concentración, y por eso los péptidos suelen medirse a mayor concentración o con una longitud de paso mayor.

Entender los campos de entrada

Coeficiente de extincion (M-1 cm-1)
El coeficiente a 280 nm, en M^-1 cm^-1.
Atencion: Tiene que ser el coeficiente molar y no un coeficiente de extinción en masa. Los coeficientes en masa en mL g^-1 cm^-1 necesitan la masa molar para convertirse.
Concentracion (M)
La concentración molar en mol/L.
Atencion: Diez micromolar es 1e-5 M, no 10. Escribir 10 en lugar de 0.00001 da una absorbancia de 55000, que es algo que ningún instrumento informa.
Longitud de paso (cm)
La longitud de paso óptico de la cubeta en centímetros. Los microlitros se leen en amplificadores de longitud de paso, que pueden ser mucho más largos que 1 cm.

Entender los resultados

Absorbancia (A)
La absorbancia prevista, sin unidades. Los valores por encima de unos 2 quedan fuera del rango fiable de la mayoría de los instrumentos.

Unidades explicadas

Absorbance
El logaritmo decimal negativo de la transmitancia. Sin unidades, y a menudo llamada densidad óptica.
Transmittance
La fracción de luz que pasa de largo, así que una transmitancia de 1 es ausencia total de absorción y 0.1 corresponde a una absorbancia de 1.
Molar concentration
Moles por litro. Lo que exige la ley; mg/mL no sirve.

Errores comunes

  • Introducir una concentración en masa. Es el error más grave de esta página, porque está equivocado por la masa molar y no por un factor pequeño.
  • Trabajar por encima de una absorbancia de unos 2, donde la luz espuria y la no linealidad del detector hacen que las lecturas no sean fiables.
  • Olvidar que la absorbancia es logarítmica. Duplicar la concentración duplica la absorbancia, pero no divide la luz transmitida de forma lineal por la mitad.
  • Aplicar la ley a una muestra que dispersa la luz o turbia, donde lo que se mide no es únicamente absorción.

Limitaciones importantes

  • La ley es una aproximación empírica. Las desviaciones aparecen a concentración alta, a concentración muy baja donde domina la luz espuria, y siempre que el soluto se asocie o se agregue.
  • Describe la absorción y no la dispersión, así que una muestra con partículas se leerá alta.
  • No dice nada de qué especie está absorbiendo, así que una mezcla se lee como una única absorbancia promediada.

Preguntas frecuentes

What does the Beer-Lambert absorbance calculator compute?

It computes predicted absorbance from a known extinction coefficient, concentration and path length, using A = e x c x l.

How do I use the Beer-Lambert absorbance calculator?

Enter the molar extinction coefficient, M^-1 cm^-1, from the extinction coefficient calculator or your own reference, the molar concentration, mol/L, and the path length in cm, 1 cm is the default for a standard cuvette.

What is the Beer-Lambert law?

A foundational relationship in spectrophotometry: absorbance is directly proportional to both the concentration of an absorbing species and the optical path length the light travels through, scaled by the species' own extinction coefficient.

What units does the Beer-Lambert absorbance calculator use?

Extinction coefficient in M^-1 cm^-1, concentration in mol/L, path length in cm; the result, absorbance, is a dimensionless number, technically absorbance units, AU.

When would I use the Beer-Lambert absorbance calculator rather than one of the two inverse calculators?

Use this one when you already know the concentration and want to predict what absorbance reading to expect, for example when planning a dilution to stay within a spectrophotometer's linear range.

What happens with a zero extinction coefficient on the Beer-Lambert absorbance calculator?

It is rejected as invalid; the extinction coefficient must be a positive number for the calculation to be meaningful.

How does the Beer-Lambert absorbance calculator relate to the two inverse Beer-Lambert calculators on this site?

The Beer-Lambert concentration calculator solves the same equation for concentration given absorbance, and the Beer-Lambert path length calculator solves it for path length; all three share the same underlying A = e x c x l relationship.

Is the Beer-Lambert absorbance calculator free to use?

Yes. The beer lambert absorbance calculator runs entirely client side.