Calculateur de preparation d'echantillons
Multiplie le volume par échantillon par le nombre de répliques et un pourcentage de surplus pour donner le volume total à préparer. Pour un usage de laboratoire et de recherche; pas un conseil médical ou de dosage.
Preparation de laboratoire
Champs du calculateur
Il s'agit d'un outil de reference mathematique et de laboratoire. Il ne diagnostique pas, ne traite pas et ne recommande pas de dose, et ne constitue pas un conseil medical.
Le calculateur de préparation d’échantillons détermine combien de matière préparer pour que chaque échantillon d’un jeu puisse être prélevé au même volume, y compris un pourcentage de marge supplémentaire pour absorber les pertes de pipetage.
C’est un petit calcul qui évite un vrai problème : se trouver à court de trois échantillons à la fin d’une série, sans aucun moyen de les refaire.
Le pourcentage de marge supplémentaire est la partie pratique. Tout ce qui est inférieur à environ cinq pour cent vous laisse exposé, et le bon chiffre dépend du nombre de transferts que chaque échantillon implique.
La marge supplémentaire est un pourcentage du besoin
Le calcul est le volume par échantillon multiplié par le nombre d’échantillons, multiplié par un plus la fraction de marge supplémentaire, et ce un plus est tout le contenu de l’idée. Une marge de dix pour cent est un multiplicateur de 1.1, et non de 10 ni de 1.01. C’est là que l’arithmétique glisse le plus souvent, parce qu’une marge exprimée en pourcentage invite à la lire comme un facteur plutôt que comme un incrément. Dix pour cent de cinquante millilitres font cinq millilitres, et cinquante plus cinq font cinquante-cinq, et c’est exactement ce que le facteur de 1.1 fait en dessous.
C’est un pourcentage du besoin et non du total fini, et les deux donnent des réponses qui paraissent presque identiques. Dix pour cent ajoutés à un besoin de cinquante donnent cinquante-cinq. Dix pour cent du volume fini, résolus à l’envers, signifient préparer cinquante divisé par 0.9, ce qui fait 55.56 millilitres. La première lecture est la bonne, et la seconde est la même intention calculée dans le désordre, laissant un surplus de 5.56 plutôt que de 5. Tout surplus est une décision, et il vaut mieux le décider délibérément qu’y arriver par réarrangement.
Un second angle chiffré à une autre échelle. Un demi-millilitre chacun sur quatre-vingt-seize échantillons donne un besoin nu de quarante-huit millilitres, et une marge de cinq pour cent donne 50.4 millilitres à préparer, soit un surplus de 2.4 millilitres et donc moins de cinq échantillons. C’est généralement le bon ordre de grandeur pour une plaque où le risque est une perte de pipetage isolée plutôt qu’un transfert répété. Remarquez aussi que les entrées sont uniquement en millilitres, si bien qu’une préparation à l’échelle du microlitre doit être convertie avant d’être saisie, et le convertisseur d’unités de volume est l’endroit où le faire.
Ce qu’une marge en pourcentage fixe se trompe de
Un pourcentage fixe est une réponse approximative à une question qui ne porte pas vraiment sur les pourcentages. Ce qu’il absorbe, c’est le volume mort : le film laissé dans une pointe de pipette, le résidu dans le récipient source, le volume qu’une pointe contient mais ne peut pas délivrer, la goutte qui reste dans le puits. Le volume mort est une grandeur absolue, à peu près fixe pour une pointe donnée, si bien que le pourcentage qu’il représente baisse quand le volume par échantillon monte. Une perte de 0.05 mL par échantillon fait cinq pour cent d’un échantillon d’un millilitre et un demi-pour cent d’un échantillon de dix millilitres, avec la même pipette et le même transfert imprudent.
La perte se multiplie aussi avec le nombre de transferts. Un échantillon qui demande trois transferts porte environ trois fois la perte d’un échantillon qui n’en demande qu’un, si bien que le volume nécessaire croît comme le volume par échantillon multiplié par le nombre multiplié par les transferts. Ce produit est ce que le pourcentage de marge supplémentaire essaie réellement d’estimer, et c’est pourquoi la bonne marge dépend de la méthode plutôt que du nombre d’échantillons. Un chiffre fixe qui convient à un transfert direct depuis un réservoir sera insuffisant pour un jeu en série préparé, pour lequel le calculateur de dilution en série est l’outil pertinent pour la structure des transferts elle-même.
L’évaporation et la dérive de température se superposent à ces deux effets et ne sont pas du tout modélisées ici. Un jeu préparé laissé ouvert pendant une longue séance perd du solvant, ce qui augmente la concentration de chaque échantillon qu’il contient de la fraction de volume qui s’est évaporée. Que cela compte ou non dépend de la tolérance de ce à quoi les échantillons servent, et c’est totalement invisible dans un chiffre de volume total, ce qui est le moment où cela cesse d’être un problème d’arithmétique pour devenir un problème de manipulation. Le guide sur l’arrondi et les petits volumes traite la question voisine de savoir jusqu’où l’arithmétique des petits volumes reste fiable.
Compter les échantillons honnêtement
Le compte est fixé dès qu’on le tape, et il vaut donc la peine de décider d’abord ce qui compte. Les témoins, les blancs et la courbe d’étalonnage entière sont des échantillons eux aussi, et ce sont ceux qu’on oublie le plus souvent parce qu’ils ne sont pas la chose mesurée. Chaque point d’une courbe d’étalonnage a besoin de sa propre préparation au même volume par échantillon que les inconnus, si bien qu’une courbe à six points avec doublons a déjà ajouté une douzaine de récipient avant même que les inconnus commencent. Lorsque les niveaux de la courbe sont obtenus en mettant une préparation mère à l’échelle vers différents volumes, le calculateur de mise à l’échelle de lot est l’arithmétique correspondante, et chaque niveau a toujours besoin de sa propre marge supplémentaire.
Compter quelques échantillons de trop ne coûte rien, et se trouver à court n’est pas gratuit. Un jeu qui se termine avec un échantillon de moins a déjà été fabriqué avec la marge choisie, et on ne peut pas le compléter sans perturber ce qui a déjà été dispensé. Le compte doit aussi être un nombre entier, si bien qu’un nombre d’échantillons prévu est arrondi à l’entier supérieur avant d’être saisi et non après. Si certains échantillons sont susceptibles d’être répétés, comptez cette possibilité maintenant au lieu d’en faire un problème ultérieur, et souvenez-vous que ce qui sort est un volume : un surplus exprimé en millilitres doit donc être redivisé par le volume par échantillon pour voir à combien d’échantillons de réserve il correspond réellement.
Un volume total n’est pas une recette
Ce qui sort est un volume à préparer, et non une méthode pour le préparer. Pour le fabriquer réellement, il vous faut la masse de composé à laquelle ce volume correspond et la concentration que vous voulez, et ce sont là deux autres calculs. En partant d’un solide, la masse découle de la concentration multipliée par le volume, ce qui est le calculateur de solution mère . En partant d’une solution mère, le volume de solution mère découle de la relation C1V1, le volume de diluant étant le reste, et le calculateur de dilution C1V1 fait cette répartition en une étape.
Une fois le volume de solution mère et le volume de diluant connus, les combiner est la moyenne pondérée par les volumes du calculateur de mélange de solutions , ce qui est le même raisonnement à l’envers : la quantité totale de soluté est fixée par ce qui a été pesé, si bien que la concentration finale découle du volume final. Si une préparation doit servir un second usage à une autre taille, ce rapport est à nouveau un problème de mise à l’échelle de lot. Et la marge ajoutée ici ne porte que sur le volume. Rien sur cette page ne décide de la concentration, ne vérifie que la masse requise se dissoudra dans ce volume, ni ne confirme qu’une solution mère à une concentration utilisable existe pour être diluée au départ.
Comment fonctionne cette calculatrice
Multipliez le volume par échantillon par le nombre d’échantillons pour obtenir le volume de base. Puis multipliez par un plus la fraction de marge supplémentaire pour obtenir le volume à préparer effectivement.
Une marge de dix pour cent sur cinquante échantillons donne cinq échantillons de plus, ce qui suffit à absorber une perte de pipetage sur les derniers sans laisser de grand surplus.
Les formules
-
total volume = per sample volume x number of samples x (1 + overage/100)
- overage
- le pourcentage de marge supplémentaire à préparer par-dessus le besoin strict
Le 1 + est tout l’essentiel. Une marge de 10 donne un facteur de 1.1, et non 10.
Exemple resolu
Préparer 1 mL chacun pour 50 échantillons avec 10 pour cent de marge
Exemple illustratif. Les nombres sont choisis pour que l arithmetique soit facile a verifier. Ce n est ni une dose, ni un protocole, ni une recommandation.
Donnees
- Volume par échantillon
- 1 mL
- Nombre d’échantillons
- 50
- Marge supplémentaire
- 10%
- Volume de base
- Substitution
- 1 mL x 50
- Resultat
- 50 mL
- Ajouter la marge
- Substitution
- 50 mL x 1.10
- Resultat
- 55 mL
Ce que cela montre
Cinquante-cinq millilitres, soit un surplus de cinq échantillons. Sans la marge, vous auriez exactement cinquante millilitres pour cinquante échantillons d’un millilitre, sans rien laisser pour une perte de pipetage sur l’échantillon quarante-neuf, et c’est là que cela échoue toujours.
Comprendre les entrees
- Volume par echantillon (mL)
- Le volume dont chaque échantillon a besoin, en mL. C’est par échantillon, pas le total.
- Nombre d'echantillons
- Combien d’échantillons. En comptant les témoins et les blancs, pas seulement les inconnus.
- Marge supplementaire (%)
- Le pourcentage de marge supplémentaire à ajouter par-dessus.
- Attention: Saisir 10 en entendant dix pour cent donne un facteur de 1.1, ce qui est correct. Saisir 0.1 ne donnerait aucune marge du tout, puisque le champ attend un pourcentage.
Comprendre les resultats
- Volume total a preparer (mL)
- Le volume total à préparer, marge supplémentaire comprise.
Unites expliquees
- Overage
- Matière préparée au-delà du besoin strict, pour absorber les pertes. Exprimée en pourcentage du besoin et non du volume final.
Erreurs courantes
- Appliquer la marge à la mauvaise base. C’est un pourcentage du besoin, donc 10 pour cent de 50 mL font 5 mL, ce qui donne 55, et non 50 plus 10 pour cent de 55.
- Oublier que la perte de pipetage par transfert se compose avec le nombre d’échantillons et le nombre de transferts par échantillon.
- Utiliser un volume par échantillon qui inclut déjà un volume mort, ce qui compte deux fois.
Limitations importantes
- Une marge en pourcentage fixe suppose la même perte pour chaque échantillon, ce qui est optimiste. Les pertes sont généralement concentrées sur les derniers échantillons.
- Ne modélise ni la masse volumique ni l’évaporation, qui comptent toutes deux pour les longues séances de préparation.
Foire aux questions
What does the sample prep calculator compute?
It computes the total volume needed to prepare a given number of replicate samples of a fixed per-sample volume, with an optional overage percentage for pipetting dead volume or waste.
How do I use the sample prep calculator?
Enter the volume needed per sample, the number of samples you are preparing, and an optional extra percentage to account for pipetting loss. The calculator returns the total volume to prepare.
What is the formula behind the sample prep calculator?
Total volume = per-sample volume x number of samples x (1 + extra percent / 100).
Why include an overage percentage on the sample prep calculator?
Real pipetting always leaves some dead volume in tips and tubes, so preparing exactly the sum of per-sample volumes with no overage often leaves you short for the last sample or two; a small buffer percentage avoids that.
What happens if I leave the overage field blank on the sample prep calculator?
It defaults to 0 percent overage, giving you the exact sum with no buffer, if that is what you intend.
What units does the sample prep calculator use?
Volume in mL for both the per-sample input and the total volume result.
Does the number of samples have to be a whole number on the sample prep calculator?
Yes, the sample count must be a positive whole number; a fractional or zero sample count is rejected as invalid.
Is the sample prep calculator free?
Yes. The sample prep calculator runs entirely client side.
Calculateurs associes
- Calculateur de melange de solutions Combine plusieurs solutions de volume et de concentration connus en un volume total, une masse totale et la concentration résultante. Pour un usage de laboratoire et de recherche; pas un conseil médical ou de dosage.
- Calculateur de pourcentage de recuperation Divise la quantité récupérée par la quantité attendue et multiplie par 100 pour donner le pourcentage de récupération. Pour un usage de laboratoire et de recherche; pas un conseil médical ou de dosage.
- Calculateur de pourcentage de rendement Divise le rendement réel par le rendement théorique maximal et multiplie par 100 pour donner le pourcentage de rendement. Pour un usage de laboratoire et de recherche; pas un conseil médical ou de dosage.
- Calculateur de correction de purete Multiplie une masse brute par son pourcentage de pureté indiqué pour donner la masse effective de substance active. Pour un usage de laboratoire et de recherche; pas un conseil médical ou de dosage.