Das Molekulargewicht sieht nach einem zusätzlichen Schritt zwischen Fläschchenetikett und allem aus, was Sie berechnen wollen. Es ist kein zusätzlicher Schritt. Es ist die Zahl, die Masse und Moleküle verknüpft, und ohne sie können Sie zwei Peptide nicht vergleichen, nicht in molaren Einheiten arbeiten und nichts verwenden, das als Konzentration angegeben ist.
Was diese Zahl ist
Das Molekulargewicht eines Peptids ist die Masse eines Moleküls in Dalton, und das ist numerisch identisch mit Gramm pro Mol. Diese beiden Einheiten sind dieselbe Größe in anderer Kleidung, und deshalb lässt sich eine molare Masse dort verwenden, wo ein Molekulargewicht erwartet wird.
Sie können es aus der Sequenz berechnen. Der Rechner für das mittlere Molekulargewicht summiert die mittlere Masse jedes Restes und addiert ein Wasser für die beiden freien Enden. Ein Peptid aus 31 Resten liegt bei etwa 3755 g/mol, ein Peptid aus 15 Resten bei etwa 1700 g/mol. Die Zahl wächst mit der Länge, und deshalb ist sie wichtig.
Warum man es braucht
Von Masse zu Mol. Mol ist die Größe, mit der die Chemie vergleicht. Division durch das Molekulargewicht wandelt eine Masse in Mol um, und das ist der einzige Weg vom Etikett zur Molarität. Der Masse-zu-Mol-Rechner ist eine Division.
Molarität gegen Massenkonzentration. Aus mg/mL wird ohne ihn kein mM, denn der Umrechnungsfaktor ist das Molekulargewicht. Der Masse-zu-Molarität-Umrechner ist der Schritt, in dem das auftaucht.
Extinktionskoeffizienten. Das Beer-Lambert-Gesetz nimmt eine molare Konzentration an, ein über Extinktion gemessenes Peptid braucht also sein Molekulargewicht, um von der gewogenen Masse auf die benötigte Konzentration zu kommen.
Produkte vergleichen. Kosten pro Milligramm sind zwischen Peptiden nicht vergleichbar, Kosten pro Mikromol schon, und die Umrechnung zwischen beiden ist das Molekulargewicht.
Mittlere Masse gegenüber monoisotopischer Masse
Zwei Rechner auf dieser Seite liefern für dieselbe Sequenz eine andere Zahl, und der Unterschied ist eine Konvention und kein Fehler.
Das mittlere Molekulargewicht verwendet die mit der natürlichen Häufigkeit gewichtete mittlere Masse jedes Elements. Es ist das, was ein Anbieter auf ein Etikett druckt und was Sie wiegen, benutzen Sie es also immer, wenn das Ergebnis einer realen Größe entsprechen muss.
Die monoisotopische Masse verwendet nur das häufigste Isotop jedes Elements. Es ist das, was ein Massenspektrometer meldet, benutzen Sie sie also, wenn Sie gegen einen gemessenen Peak oder eine als monoisotopisch angegebene Spezifikation vergleichen.
Sie unterscheiden sich um etwa drei Zehntel Dalton pro Rest, die Differenz ist also vernachlässigbar für ein Tripeptid und relevant für eines aus dreißig Resten. Sie zu vermischen ist nicht katastrophal, aber es ist eine echte Inkonsistenz, und der Rechner für monoisotopische Masse existiert, damit Sie konsistent bleiben können.
Woher es nicht kommt
Ein Molekulargewicht ist keine Messung von Reinheit, Identität oder Potenz. Es ist eine Formelbilanz. Es berücksichtigt auch nicht die Form, die Sie tatsächlich haben: ein Salz, ein Gegenion oder ein Hydrat trägt zusätzliche Masse bei, ohne zusätzliche Moleküle zu tragen, eine gewogene Salzprobe wiegt also mehr als der Wert der freien Base, enthält aber dieselbe Anzahl Moleküle.
Wenn ein Anbieter ein Molekulargewicht angibt, das nicht zu Ihrer Berechnung aus der Sequenz passt, ist der Unterschied meist eine Modifikation, ein Salz oder ein anderer Rest, und die Gegenprüfung der molaren Masse beziffert die Lücke.
Die Zahl bekommen
Aus einer Sequenz: der Rechner für das mittlere Molekulargewicht, der für eine unveränderte Kette mit freien Enden exakt ist. Aus einer Spezifikation: vertrauen Sie ihr und prüfen Sie sie gegen die Sequenz. Aus einem Peptid ohne Sequenz und ohne verlässliche Spezifikation: Sie können es nicht wissen, und kein Rechner kann Ihnen helfen.
Verwandt: Molekulargewicht aus einer Sequenz berechnen und Molarität gegen Massenkonzentration.