La masse molaire ressemble à une étape supplémentaire entre l’étiquette d’un flacon et tout ce que vous voulez calculer. Elle n’est pas supplémentaire. C’est le nombre qui relie la masse aux molécules, et sans lui vous ne pouvez pas comparer deux peptides, travailler en unités molaires, ni utiliser quoi que ce soit qui soit spécifié comme une concentration.
Ce qu’est ce nombre
La masse molaire d’un peptide est la masse d’une molécule, en daltons, ce qui est numériquement identique à des grammes par mole. Ces deux unités sont la même grandeur sous des habits différents, et c’est pourquoi la masse molaire peut être employée là où l’on attend un poids moléculaire.
Vous pouvez la calculer à partir de la séquence. Le calculateur de masse molaire moyenne additionne la masse moyenne de chaque résidu et ajoute une eau pour les deux extrémités libres. Un peptide de 31 résidus avoisine 3755 g/mol ; un peptide de 15 résidus avoisine 1700 g/mol. Le nombre croît avec la longueur, et c’est pourquoi il compte.
Pourquoi elle est nécessaire
De la masse aux moles. Les moles sont ce que la chimie compare. Diviser par la masse molaire convertit une masse en moles, et c’est le seul chemin qui va d’une étiquette à une molarité. Le calculateur masse vers moles est une division.
Molarité contre concentration en masse. Les mg/mL ne peuvent pas devenir des mM sans elle, car le facteur de conversion est la masse molaire. Le convertisseur masse vers molarité est l’étape où cela apparaît.
Coefficients d’extinction. La loi de Beer-Lambert part d’une concentration molaire, donc un peptide mesuré par absorbance a besoin de sa masse molaire pour passer de la masse que vous avez pesée à la concentration dont vous avez besoin.
Comparer des produits. Le coût au milligramme n’est pas comparable entre peptides ; le coût à la micromole l’est, et la conversion entre les deux est la masse molaire.
Moyenne contre monoisotopique
Deux calculateurs de ce site renvoient un nombre différent pour la même séquence, et la différence est une convention et non une erreur.
La masse molaire moyenne utilise la masse moyenne de chaque élément pondérée par son abondance naturelle. C’est ce qu’un fournisseur imprime sur une étiquette et ce que vous pesez, donc employez-la chaque fois que le résultat doit correspondre à une quantité réelle.
La masse monoisotopique utilise uniquement l’isotope le plus abondant de chaque élément. C’est ce que rapporte un spectromètre de masse, donc employez-la pour comparer à un pic mesuré ou à une spécification citée en monoisotopique.
Elles diffèrent d’environ trois dixièmes de dalton par résidu, donc l’écart est négligeable pour un tripeptide et notable pour un peptide de trente résidus. Les mélanger n’est pas catastrophique, mais c’est une vraie incohérence, et le calculateur de masse monoisotopique existe pour vous permettre d’être cohérent.
Ce qu’elle ne vient pas de
Une masse molaire n’est pas une mesure de pureté, d’identité ou d’activité. C’est un bilan de formule. Elle ne tient pas non plus compte de la forme que vous avez réellement : un sel, un contre-ion ou un hydrate apporte de la masse supplémentaire sans apporter de molécule supplémentaire, donc un échantillon de sel pesé pèse plus que le chiffre de la base libre tout en contenant le même nombre de molécules.
Si un fournisseur annonce une masse molaire qui ne correspond pas à votre calcul à partir de la séquence, la différence est généralement une modification, un sel ou un résidu différent, et le recoupement de masse molaire quantifie l’écart.
Obtenir le nombre
À partir d’une séquence : le calculateur de masse molaire moyenne, qui est exact pour une chaîne non modifiée à extrémités libres. À partir d’une spécification : faites-lui confiance, et vérifiez-la contre la séquence. À partir d’un peptide sans séquence et sans spécification fiable : vous ne pouvez pas le savoir, et aucun calculateur ne peut vous aider.
Voir aussi : calculer la masse molaire à partir d’une séquence et molarité contre concentration en masse.