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Peptide Calculator

Punto isoeléctrico del péptido (pI), explicado

Publicado 3 min de lectura

El punto isoeléctrico (pI) es el valor de pH en el cual la carga eléctrica neta de un péptido es exactamente cero. No es una constante estática de catálogo, sino la solución numérica a una ecuación de equilibrio químico.

¿Qué es el punto isoeléctrico?

A un pH específico, la carga neta del péptido es la sumatoria de las cargas aportadas por todos sus grupos ionizables: el grupo amino N-terminal libre, el carboxilo C-terminal libre y las cadenas laterales ionizables (Asp, Glu, Cys, Tyr, His, Lys, Arg).

Cada grupo contribuye según la distancia entre el pH circundante y su propio pKa, gobernado por la relación de Henderson-Hasselbalch. La calculadora de carga neta ejecuta esta sumatoria precisa término a término.

El pI: la raíz donde la carga neta es cero

La curva de carga neta decrece monotónicamente respecto al pH: a pH extremadamente ácido, todos los grupos están protonados alcanzando la máxima carga positiva; a pH alcalino, se desprotonan alcanzando la carga negativa máxima. El punto de corte exacto con el eje cero define el punto isoeléctrico.

No existe una fórmula algebraica cerrada para despejar el pH cuando intervienen múltiples grupos ionizables heterogéneos, por lo que se requiere un método numérico.

Resolución numérica por bisección

La calculadora de punto isoeléctrico utiliza el método iterativo de bisección entre pH 0 y pH 14. En cada iteración, se evalúa el punto medio del intervalo y se reduce el rango a la mitad, convergiendo con una tolerancia inferior a 1e-6 unidades de pH en menos de 100 ciclos.

La escala de pKa de Bjellqvist

Los valores de pKa de referencia provienen de la escala publicada por Bjellqvist et al. (1993, 1994), la misma utilizada internacionalmente por el servidor ExPASy Compute pI/Mw. Fijar esta escala garantiza resultados consistentes y reproducibles.

Visualización gráfica y fracciones cargadas

Para comprender la amortiguación del sistema, la calculadora de curva de carga vs. pH traza la transición de carga completa entre pH 0 y 14. Por su parte, la calculadora de fracción de residuos cargados cuantifica el porcentaje global de residuos ionizables en la molécula.

En resumen

El pI de un péptido es el pH donde su carga neta, calculada sumando la contribución de Henderson-Hasselbalch de cada grupo ionizable, cruza exactamente por cero.

Literatura científica y citas primarias

  • Bjellqvist, B., Hughes, G. J., et al. (1993). The focusing positions of polypeptides in immobilized pH gradients can be predicted from their amino acid sequences. Electrophoresis, 14(1), 1023-1031. PubMed PMID: 8125050. DOI: 10.1002/elps.11501401163. Escala seminal de pKa para predicción de pI en gradientes inmovilizados.
  • Bjellqvist, B., Basse, B., Olsen, E., & Celis, J. E. (1994). Reference points for comparisons of two-dimensional maps. Electrophoresis, 15(1), 529-539. PubMed PMID: 8055880. Calibración de pKa para electroforesis bidimensional en gel.
  • Nelson, D. L., & Cox, M. M. (2021). Lehninger Principles of Biochemistry (8va ed.). W. H. Freeman. Capítulo 3: Aminoácidos, péptidos y proteínas.
  • Gasteiger, E., et al. (2005). Protein Identification and Analysis Tools on the ExPASy Server. En The Proteomics Protocols Handbook, Humana Press, 571-607.

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