ভর থেকে অনুক্রম অনুমানকারী

ভরকে অনুক্রমে ফেরানো একটি অপর্যাপ্ত সংজ্ঞায়িত সমস্যা, আর এই পাতার যেকোনো অন্য কিছুর আগে সেটি সোজাসাপটা বলা দরকার। একটি ভর একটি সংখ্যা। একটি অনুক্রম হলো প্রতি অবশিষ্টে একটি করে বেছে নেওয়ার ধারাবাহিকতা। কোনো নির্দিষ্ট মাপা ভরের সঙ্গে সামঞ্জস্যপূর্ণ কতগুলো অনুক্রম সম্ভব তা অসম্পূর্ণ, আর কোনো পরিমাণ গণিত একটিকে অন্যটিতে রূপান্তর করে না। তাই এই পাতা যা ফেরত দেয় তা কোনো প্রার্থী অণু নয়, দৈর্ঘ্যের একটি অনুমান, আর সংখ্যার একটি স্তম্ভে বসে থাকা অবস্থায় দৈর্ঘ্য দাবি তার চেয়ে অনেক দুর্বল দাবি।

অস্পষ্টতার দুটি স্বাধীন উৎস আছে, আর ওদের আলাদা রাখলে পুরো সমস্যাটি যুক্তি দিয়ে বিবেচনা করা অনেক সহজ হয়। প্রথমটি হলো ক্রম। একই অবশিষ্টের একই বহু-সমাষ্টির প্রতিটি পুনর্বিন্যাসের ভর হুবহু এক, কারণ ভর একটি যোগ, আর যোগ পদগুলো কী ক্রমে এসেছে তা খেয়াল করে না। তাই রচনা কোনোভাবে হুবহু নির্ধারিত হয়েও গেলেও অনুক্রমটি নিজে অনির্ধারিত থাকত, আর গণিতে কতটাই সাবধানতা নেওয়া হোক তা সেটি বদলাতে পারত না। দশটি ভিন্ন অবশিষ্টের দশ অবশিষ্টের শৃঙ্খলে তিন লক্ষের বেশি বিন্যাস একটি ভর ভাগ করে নেয়, রচনার প্রশ্নটি তোলার আগেই।

দ্বিতীয়টি হলো রচনা। ভিন্ন বহু-সমাষ্টি একই ভরে যোগ হতে পারে, নিজেদের একই বহু-সমাষ্টি না হয়েও, তাই ভর রচনাও ঠিক করে না। এই দুটি অস্পষ্টতা শুধু যোগ হয় না, গুণ হয়, যে কারণেই সম্ভাবনার জায়গাটি শুধু বড় নয়, একটি মাত্র ভর মাপ কী বলতে সক্ষম তার চেয়েও সীমাবদ্ধ নয়। সম্ভাবনা সরু করতে যে কোনো পদ্ধতি দেখা যায় সে আপনার দেওয়া কিছু যোগ করছে, বা অনুমান করছে। এই কারণেই যেকোনো ডেটাবেস থেকে পাওয়া মিলের যেকোনো তালিকা হলো সেই তালিকা, যা ভর বাদ দেয় না, সেই তালিকা নয় যা এটি প্রমাণ করে, আর ফলাফল যেভাবে সাজানো হয়েছে তার কারণেই এই পার্থক্যটি সাধারণত ঝাপসা হয়ে যায়।

অনুমানটি ঠিক একটিমাত্র সংখ্যার ওপর দাঁড়ানো: বিশটি গড় অবশিষ্ট ভরের গড়, যা প্রায় 118.9 আর কোনো বাস্তব পেপটাইডের। একটি শৃঙ্খল যে একটি জল যোগ করে তা বাদ দিন আর বাকিটা সেই গড়ে ভাগ করুন, তাহলে কাছাকাছি সঠিক একটি দৈর্ঘ্য পান। তাই পুরো পদ্ধতি একটি অনুমানের ওপর দাঁড়ানো, যে রচনা পক্ষপাতহীন, আর এটিই সেই অনুমান যা বাস্তব পেপটাইড সবচেয়ে বেশি ভাঙে, কারণ অনেককেই ইচ্ছাকৃতভাবে এক বা দুটি অবশিষ্টে সমৃদ্ধ করা হয়। অনুমানটি নিজের ব্যর্থতা ধরতে পারে না, কারণ প্রায় সম্পূর্ণ গ্লিসিনে তৈরি একটি শৃঙ্খল আর সাধারণ অবশিষ্ট মিশ্রণযুক্ত একটি শৃঙ্খল একই দৈর্ঘ্য ফেরত দেয়, অথচ প্রকৃত ভরে প্রায় তিনগুণ পার্থক্যে আলাদা।

এটি কতটা ভাঙে তা মাঝখানে নয়, দুই প্রান্তে বেশি স্পষ্ট। গ্লিসিন হলো সবচেয়ে হালকা অবশিষ্ট প্রায় 57.05 আর আর্গিনিন সবচেয়ে ভারী প্রায় 156.19, প্রায় তিনের কাছাকাছির অনুপাত। 1000 Da একটি লক্ষ্য ধরুন, জল বাদ দিন আর সবচেয়ে ভারী অবশিষ্টে ভাগ করুন, তাহলে সবচেয়ে ছোট শৃঙ্খল, যা ওই ভর হতে পারে, ছয় অবশিষ্ট। সবচেয়ে হালকা অবশিষ্টে ভাগ করলে সবচেয়ে বড়টি সতেরো। একটি মাপা ভর ছয় অবশিষ্ট থেকে সতেরো অবশিষ্ট পর্যন্ত যেকোনো কিছুর সঙ্গে সামঞ্জস্যপূর্ণ, আর আটের অনুমান সেই পরিসরের ভেতরে বসে, অথচ সেখানে কোনোভাবে আলাদা নয়।

একটিমাত্র সংখ্যা থেকে সম্ভাব্য শৃঙ্খল দৈর্ঘ্যে প্রায় তিনগুণের এই গুণটা সমস্যার একটি বৈশিষ্ট্য, অনুমানের কোনো ত্রুটি নয়, আর কোনো প্রতিবেদনের ধারা এটি বদলাতে পারে না। পেপটাইড দৈর্ঘ্য ক্যালকুলেটর আর গড় আণবিক ভর ক্যালকুলেটর এই ক্রমেই হলো সেই জোড়া, যা সত্যিকারেরভাবে একটি অনুক্রমকে দৈর্ঘ্যের সঙ্গে যুক্ত করে, আর যে প্রশ্নটি হলো পড়া একটি শৃঙ্খলের বদলে এতে যোগ হয়েছে বা হারানো হয়েছে তা নিয়ে, সেটির জন্য ভর পার্থক্য ক্যালকুলেটর । একই দুটি পাতা উল্টো দিকে চালালে সম্পূর্ণ নির্ধারিত, আর সেই অসমতাটিই এই পাতাকে কোনো সমস্যার সমাধান নয়, অনুমান তৈরির হাতিয়ার বানিয়ে দেয়।

অস্পষ্টতার কিছু অংশ সাধারণ ক্ষেত্রের চেয়ে অনেক তীক্ষ্ণ, কারণ কিছু অবশিষ্ট সংমিশ্রণ ভরকে আনুমানিক নয়, হুবহু ভাগ করে। লিউসিন আর আইসোলিউসিন প্রচলিত উদাহরণ: দুটোর অবশিষ্ট ভরই 113.08406, তাই কোনো প্রাপ্য নির্ভুলতার ভর মাপেই ওদের আলাদা করা যায় না। দুটি গ্লিসিন 114.04292 হয় আর অ্যাসপ্যারাজিন 114.04293, আর অ্যালানিন ও গ্লিসিন একসঙ্গে 128.05857 হয় আর গ্লুটামিন 128.05858। এগুলো ভরের নিজেই সমতা, উত্তর যন্ত্র দিয়ে মেলানো যায় এমন গোল করার কাকতালীয়তা নয়। যেকোনো অনুক্রমে একটি লিউসিন থাকলে তার একটি সমভার জোড়া থাকে যেখানে প্রতিটি লিউসিনের বদলে আইসোলিউসিন, আর একই মনোআইসোটপিক ভরের পাশাপাশি একই গড় ভর।

এটিই সমস্যাটি একটি ভর থেকে সমাধানযোগ্য নয়, এর সবচেয়ে তীক্ষ্ণ বক্তব্য। একটি ত্রুহীন, হুবহু সঠিক ভর মাপ, যন্ত্রটি যত দশমিক ঘর পর্যন্ত জানাতে পারে তত নিভুলভাবে, তবুও অনুক্রমের গোটা পরিবার একে অপর থেকে আলাদা থেকে যায়। মনোআইসোটপিক ভর ক্যালকুলেটর আপনাকে যত নিভুলতা সম্ভব সেই হুবহু সংখ্যাটি দেবে, আর তবুও অস্পষ্টতাটি রেখে দেবে। আরও নিখুত্যেত যন্ত্র সহনশীলতা সরু করে আর তালিকা ছোট করে, কিন্তু কখনো তা একটি ভুক্তিতে নামিয়ে আনে না। ফাঁকটি বন্ধ করে এমন কিছু আলাদা ধরনের মাপ, সেই একই মাপের আরও ভালো বিভাজন নয়।

যে কেউ প্রার্থীদের তালিকা পড়ছেন তার ক্ষেত্রে পরিণতিটি সরাসরি। এরূপ তালিকার ক্রম কোনো সম্ভাবনার স্থানানুক্রম নয়, আর প্রথম ভুক্তিটি উত্তর নয়। একটি ভরের মিলকে শনাক্তকরণ হিসেবে গোনা মানে প্রথম যা মানানসই হয় তাকেই গ্রহণ করা, যা ঠিক সেই সংজ্ঞা যে ফলাফলের বেশাক্ষেতে সাজানো অনুমান। ঠিক এটি করা খুব কাছে যায়, কারণ একটি লম্বা তালিকা প্রমাণের মতো দেখায় আর ফলাফলের কোনো লাইনও অন্যরকম বলে না, অথচ ক্রমটি প্রতিচ্ছবির গঠন বলে দেয়, নমুনা সম্পর্কে কিছু বলে না।

তাহলে ভর কোন কাজে লাগে? এটি কিছু বাদ দেয়, সস্তায় আর সাথে সাথে। নির্দিষ্ট দৈর্ঘ্যের একটি শৃঙ্খলের ভর তার অবশিষ্টগুলো যে পরিসরে পারে তার বাইরে কোথাও যেতে পারে না, আর লক্ষ্যের চেয়ে অনেক উচ্চতর একটি ভর সরাসরি এই পাতার যে অনুমান তার চেয়ে কম দৈর্ঘ্যের যেকোনো অনুমানকে পরিপন্থী করে দেয়। এটি আকার সম্পর্কে একটি অনুমানকেও সমর্থন করতে পারে, আর এই পাতাটি সেই কাজের জন্যই তৈরি। এর বাইরে এটি একটি সীমাবদ্ধতা, আর সীমাবদ্ধতা তখনই প্রমাণে পরিণত হয় যখন এর সঙ্গে কিছু স্বাধীন যোগ করা হয়। এটি সত্যিই কার্যকর একটি কাজ, যদিও শোনায় সামান্য, কারণ আকার সম্পর্কে ভুল প্রত্যাশা করা একটি সহজ ভুলগুলোর একটি আর পরিণামে ধরা পড়া অন্যতম দামি।

পরিচয় প্রতিষ্ঠা করতে দ্বিতীয়, স্বাধীন পর্যবেক্ষণ লাগে: একটি ডাইজেস্ট থেকে পাওয়া ফ্র্যাগমেন্টের প্যাটার্ন, ভিন্ন আয়নীকরণ বা ডেরিভেটাইজেশন থেকে পাওয়া দ্বিতীয় ভর, প্রমাণিত পদার্থের বিপরীতে রিটেনশন সময়, বা সরাসরি অনুক্রম পরিমাপ। ওদের যেকোনো একটি একটি ভরকে আসল প্রমাণে পরিণত করে, আর এদের একটিও এখানে বা এই সাইটের অন্য কোথাও সম্পাদিত হয় না। যখন অনুক্রম আগে থেকেই আপনার হাতে থাকে আর জানতে চান তার ভর কত হওয়ার কথা, তখন অনুক্রম থেকে পেপটাইডের আণবিক ভরের নির্দেশিকা সেই গণিতটি সেই দিকে চালায় যেটি আসলে নির্ধারিত, আর মনোআইসোটপিক ভর বনাম গড় আণবিক ভর নির্দেশিকা বলে কোন ধারাটি আগে বসাতে হবে।