পেপটাইডের নেট চার্জ কোনো অপরিবর্তনীয় সংখ্যা নয়; এটি চারপাশের তরলের pH-এর ওপর নির্ভরশীল এবং হেন্ডারসন-হ্যাসেলবালখ সমীকরণ দিয়ে গণনা করা হয়। শৃঙ্খলের প্রতিটি আয়নিত গ্রুপের (N-টার্মিনাস, C-টার্মিনাস, সাইড চেইন) আধান যোগ করে মোট নেট চার্জ পাওয়া যায়।
হেন্ডারসন-হ্যাসেলবালখ সমীকরণ দিয়ে নেট চার্জ কীভাবে বের করবেন
ক্ষারীয় গ্রুপের ক্ষেত্রে (প্রোটোনেটেড রূপ ধনাত্মক):
চার্জ অবদান = ১ / (১ + ১০^(pH - pKa))অম্লীয় গ্রুপের ক্ষেত্রে (ডিপ্রোটোনেটেড রূপ ঋণাত্মক):
চার্জ অবদান = -১ / (১ + ১০^(pKa - pH))সমস্ত আয়নিত গ্রুপের সমষ্টি
নেট চার্জ(pH) = N-টার্মিনাস + C-টার্মিনাস + সাইড-চেইনের যোগফলনেট চার্জ ক্যালকুলেটর জ্যেলকভিস্ট (১৯৯৩) স্কেল অনুযায়ী এই যোগফল সম্পন্ন করে।
আইসোইলেক্ট্রিক পয়েন্ট
যেখানে নেট চার্জ শূন্য হয়, সেটাই হলো আইসোইলেক্ট্রিক পয়েন্ট (pI)। আইসোইলেক্ট্রিক পয়েন্ট ক্যালকুলেটর এই মান নির্ণয় করে।
আনুষঙ্গিক টুলস
চার্জড রেসিডিউ ফ্র্যাকশন ক্যালকুলেটর আয়নীয় অংশের অনুপাত জানায় এবং অ্যারোমেটিসিটি ক্যালকুলেটর অ্যারোমেটিক অ্যামিনো অ্যাসিডের শতাংশ পরিমাপ করে।
সংক্ষেপে, যেকোনো pH-এ পেপটাইডের নেট চার্জ = N-টার্মিনাস + C-টার্মিনাস + সাইড-চেইনের যোগফল, হেন্ডারসন-হ্যাসেলবালখ সমীকরণ অনুযায়ী গণনা করা হয়।
বৈজ্ঞানিক তথ্যসূত্র ও সাইটেশন
- Henderson, L. J. (1908). Concerning the relationship between the strength of acids and their capacity to preserve neutrality. American Journal of Physiology, 21(2), 173-179. বাফার সাম্যাবস্থার মূল ভিত্তি।
- Hasselbalch, K. A. (1916). Die Berechnung der Wasserstoffzahl des Blutes. Biochemische Zeitschrift, 78, 112-144. pH স্কেলে লগারিদমিক রূপান্তর।
- Bjellqvist, B., Hughes, G. J., et al. (1993). The focusing positions of polypeptides in immobilized pH gradients. Electrophoresis, 14(1), 1023-1031. PubMed PMID: 8125050. পেপটাইড pKa মান।
- IUPAC Compendium of Chemical Terminology (Gold Book). অম্লীয় ধ্রুবক ও pH সংজ্ঞা। Pure and Applied Chemistry, 1997.